วัดคิชู เป็นวัดเก่าแก่ที่สุดแห่งหนึ่งของภูฏาน

วัดคิชู ตามประวัติว่าสร้างตั้งแต่ราวพุทธศตวรรษที่ 12 หรือราว1,300 ปีมาแล้ว ตั้งแต่สมัยที่ภูฏานยังเป็นดินแดนส่วนหนึ่งของทิเบต กษัตริย์ซองเซนกัม ซึ่งชาวทิเบตยกย่องว่า เป็นผู้อัญเชิญศาสนาพุทธสายวัชรยานตันตระมาประดิษฐานในทิเบต โปรดสร้างวัด 108 แห่ง เพื่อตอกอวัยวะ 108 จุด ของยักษ์ตนหนึ่ง ซึ่งนอนแผ่ทับเทือกเขาหิมาลัยไว้ หมายจะให้สัจธรรมคำสอนของพระพุทธเจ้าเผยแผ่ไปถึง โดยจุดที่สร้างวัดคิขุที่เมืองพาโรเป็นเท้าซ้ายของยักษ์